Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHD3Q12873 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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