Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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KCNMA1Q12791 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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