Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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