Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms