Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms