Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NHLH2Q02577 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms