Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms