Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OTUD4Q01804 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms