Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK17Q00537 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms