Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTA1P68133 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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