Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.5 ms