Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPAP53621 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPAP53621 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPAP53621 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPAP53621 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPAP53621 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms