Protein–RNA interactions for Protein: P51688

SGSH, N-sulphoglucosamine sulphohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSHP51688 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGSHP51688 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGSHP51688 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGSHP51688 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms