Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB27AP51159 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms