Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC11A1P49279 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms