Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP5P45974 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP5P45974 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP5P45974 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP5P45974 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP5P45974 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP5P45974 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP5P45974 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP5P45974 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms