Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPD3P42695 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPD3P42695 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms