Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LTBRP36941 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LTBRP36941 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms