Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACTN2P35609 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms