Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA3P35244 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA3P35244 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms