Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-FP30511 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms