Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNGA1P29973 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms