Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2E1P29083 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms