Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLD1P28340 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLD1P28340 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms