Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms