Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DMDP11532 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DMDP11532 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DMDP11532 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DMDP11532 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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