Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLA1P09884 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLA1P09884 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLA1P09884 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms