Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLBP06746 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLBP06746 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms