Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms