Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCATO75600 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCATO75600 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCATO75600 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCATO75600 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GCATO75600 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCATO75600 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCATO75600 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCATO75600 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCATO75600 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCATO75600 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCATO75600 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCATO75600 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCATO75600 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCATO75600 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCATO75600 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCATO75600 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCATO75600 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCATO75600 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCATO75600 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCATO75600 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCATO75600 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms