Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGTAO43765 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms