Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COCHO43405 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COCHO43405 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms