Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBDO15205 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBDO15205 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBDO15205 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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