Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA8JA6NMD2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms