Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFAP73A6NFT4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CFAP73A6NFT4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms