Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL33A6NCF5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms