Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AFG3L2Q9Y4W6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms