Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms