Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHANK2Q9UPX8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms