Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP164Q9UPV0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP164Q9UPV0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms