Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms