Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAX2Q9UIW0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAX2Q9UIW0 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAX2Q9UIW0 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAX2Q9UIW0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAX2Q9UIW0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAX2Q9UIW0 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VAX2Q9UIW0 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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VAX2Q9UIW0 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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VAX2Q9UIW0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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VAX2Q9UIW0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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VAX2Q9UIW0 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VAX2Q9UIW0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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