Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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COPS7AQ9UBW8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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COPS7AQ9UBW8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
COPS7AQ9UBW8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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