Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms