Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

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Length 977 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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