Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms