Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOMER3Q9NSC5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms