Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSU72Q9NP77 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms