Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms