Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ZNF407Q9C0G0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ZNF407Q9C0G0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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